W krajach w , których aborcja jest legalna nie niesie ona ze sobą takiego zagrożenia jak w przypadku nielegalnie przeprowadzanych aborcji. Specjalistyczna pomoc medyczna jest niezbędna, gdyż jej brak może przyczynić się do wystąpienia takich powikłań jak zatrucie środkami farmakologicznymi, krwotoki , a także infekcje.
W przypadku aborcji farmakologicznych w , których stosuje się mifepriston dochodzi do zwiększenia ryzyka zakażenia bakterią Clostridium sordellii , która w efekcie może prowadzić do śmierci. W celu zapobiegnięcia tego typu powikłaniom u pacjentek przed przeprowadzeniem aborcji farmakologicznej podaje się odpowiedni antybiotyk.
Do niedawna wśród kobiet panował mit mówiący o tym , że przeprowadzenie aborcji skutkuje w czasie późniejszym wystąpieniem raka piersi . To stwierdzenie było często stosowane przeciw zalegalizowaniu tego rodzaju zabiegu. W celu obaleniu tego mitu przeprowadzono wiele badań, które wykluczyły zależność aborcji z rakiem piersi. WHO- Światowa Organizacja Zdrowia potwierdziła wyniki tych badań.